Израильские ученые используют машинное обучение, чтобы открыть путь к антивиральным лекарствам
11.04.2021 18:56Новое открытие позволяет ускорить процесс поиска молекул, обладающих лекарственным эффектом.
Почему нет лекарств, которые могут вылечить Covid, SARS или грипп? Почему, если у вас ангина, вам прописывают антибиотик, а при вирусной инфекции вам говорят "надо потерпеть"? Почему у нас до сих пор нет противовирусных препаратов в таком же количестве, разнообразии и при той же эффективности, что и антибиотики?
В отличие от антибиотиков (действие которых широкое и поражает целый ряд микроорганизмов), противовирусные препараты обычно предназначены для борьбы с одним вирусом. Из-за такой ограниченности фармацевтическим компаниям невыгодно инвестировать в разработку новых противовирусных препаратов. В результате терапевтические препараты, не связанные с ВИЧ, составляют менее 1% от общего рынка лекарственных средств, что прямо контрастирует с преобладанием вирусных инфекций в повседневной жизни. Хотя очевидным решением этой проблемы является разработка противовирусных препаратов, которые можно использовать для лечения множества таких заболеваний, поиск таких препаратов широкого спектра действия оказался весьма труднодостижимой задачей.
Новаторское исследование, проведенное в сотрудничестве между лабораторией профессора Рои Амита из Техниона - Израильского технологического института (факультет биотехнологии и пищевых технологий), и группой профессора Ярона Оренштейна из Школы электротехники и вычислительной техники Университета им. Бен-Гуриона в Негеве, впервые открывает реальный путь к достижению этой цели. Исследование, проведенное доктором Ноа Кац, демонстрирует, что комбинированный подход к синтетической биологии и машинному обучению может привести к открытию молекул, способных связывать белки двух разных вирусов, тем самым блокируя их размножение в организме.
Традиционный метод выявления лекарственных средств заключается в применении малопроизводительного и трудоемкого поиска молекул, которые могут выполнять требуемую функцию. Напротив, подход синтетической биологии и машинного обучения направлен на отображение «пространства» потенциальных взаимодействий, что позволяет с высокой степенью надежности предсказать молекулы с желаемыми свойствами. Для этого сначала создается большой и высококачественный экспериментальный набор данных из библиотеки (то есть коллекции) различных известных и предполагаемых потенциальных молекул, связывающих вирус с белками. Затем набор данных используется для обучения нейронной сети, чтобы позволить ей сформировать многомерную математическую функцию, представляющую способность группы связываться с белками.
После вычисления такую функцию можно использовать в обратном порядке - для идентификации областей с высокой связывающей способностью и извлечения «предсказанных» молекул, которые ранее не тестировались. Затем эти предсказанные молекулы могут быть синтезированы и протестированы на желаемую биологическую функциональность. Исследователи применили этот подход, чтобы сначала составить карту связывающего пространства двух разных белков оболочки от двух разных вирусов, атакующих бактерии, а затем синтезировали и подтвердили молекулы РНК, которые, как было предсказано, находятся на границе между двумя пространствами и, следовательно, обладают обоими функциональные возможностями. Это достижение предоставляет научному сообществу новый путь, который можно использовать для идентификации новых последовательностей РНК, потенциально способных стать ключевыми ингредиентами противовирусных препаратов широкого спектра действия.
Источник: MFA
Фото: Авторы исследования - проф. Рои Амит, проф. Ярон Оренштейн, д-р Ноа Кац / Технион, Pixabay
Читайте также:

Израильские ученые объяснили, почему COVID-19 так опасен для пожилых
С начала пандемии коронавируса все мы знаем, что пожилое...
Исследователи Техниона открыли новый путь борьбы с раковыми клетками
Цикл фолиевой кислоты - «слабое место» раковых клеток.
В Израиле разработали самодезинфицирующуюся защитную маску
Дезинфекция осуществляется слаботочным нагреванием углеродного слоя в маске....
Израильские исследователи разработали портативные устройства ранней диагностики заболеваний
Носимые портативные устройства предоставляют...
Израильские ученые научились распознавать болезни по морганию
Изобретенное в Технионе устройство определяет болезнь Паркинсона и базедову болезньЛента новостей:

ЦАХАЛ уничтожил арсенал ракет террористов в районе Рамаллы
Силы безопасности обнаружили и уничтожили ракеты и другие виды вооружения, связанные с террористической ячейкой,...
«Флотилия Сумуда»: ВМС ЦАХАЛа вывели из строя системы связи
Армия обороны Израиля и власти Израиля пока не комментируют эти сообщения.
Отражение нападения на кибуц Нир-Ам 7.10 – героизм сил самообороны и военных. Отчет ЦАХАЛа
ЦАХАЛ опубликовал результаты расследования боев в районе кибуца Нир-Ам, около границы...
В Газе ликвидирован боевик «Нухбы», причастный к гибели прапорщика ЦАХАЛа Галеба Слимана аль Насасры
В начале сентября в секторе Газы был ликвидирован боевик, причастный к...
Нетаниягу вернулся в Израиль
Премьер-министр Биньямин Нетаниягу и сопровождавшие его в поездке в США лица вернулись в Израиль.
Ортодоксальные организации Нью-Йорка поддержали Куомо: «Мамдани призывает к глобальной интифаде»
"Мы крайне обеспокоены курсом, которым...
Хуситы грозят ударами по американским судам
Йеменская террористическая группировка «Ансар Аллах» заявила о намерении атаковать суда американских нефтяных компаний.
ХАМАС, вероятно, отклонит мирный план Трампа
Высокопоставленный представитель ХАМАС сообщил BBC, что террористическая группировка, скорее всего, отвергнет план президента США....
Трамп даст ХАМАС три-четыре дня на то, чтобы отреагировать на план по Газе
"ХАМАС либо сделает это, либо нет, и если нет, то будет очень печальный конец"
Трамп подтвердил: Нетаниягу согласился на план
"Это большой день, возможно, один из величайших дней в истории цивилизации."
Elbit Systems стала самой дорогой компанией Израиля
Оборонный концерн Elbit Systems стал самой дорогой израильской компанией, зарегистрированной на Уолл-стрит....
В мае израильские стартапы привлекли 550 млн долл
Израильский технологический сектор продолжает демонстрировать устойчивость и привлекательность...
Брин покупает израильскую компанию Wiz за 32 млрд долл
Компания Alphabet, управляющая Google покупает израильский стартап Wiz, работающий в сфере кибербезопасности, за $32 млрд.
Израильский хайтек привлёк 4 млрд долл за год
Это более чем в два раза превышает показатель предыдущего года.
Израильский туризм: теперь на подъем или дальше в пропасть?
Во время войны самый сильный экономический удар пришелся именно по туристической отрасли и в первую очередь...
Израиль запустил в космос новый спутник-шпион
«Запуск спутника Ofek 19 — это достижение высочайшего мирового уровня и послание всем нашим врагам, где бы они ни находились: мы наблюдаем за вами...
Осторожно, «капча»!
Национальная служба информационно-коммуникационных технологий раскрыла широкомасштабную международную кибератаку ShadowCaptcha
Завершена серия испытаний системы ПРО «Праща Давида»
Израильское управление противоракетной обороны и концерн "Рафаэль" завершили серию испытаний системы ПРО "Праща Давида" в рамках процесса оперативного обучения....
Марсианские ледники оказались практически чистым льдом. Израильское исследование
Исследование израильских ученых меняет взгляд на прошлое...
Израильские учёные подслушали «разговоры» растений
Это открытие позволяет предположить существование невидимой экосистемы.
Эфрат Перец-Томер, старший клинический психолог южного округа «Меухедет», объясняет, как создать адаптированную к обстоятельствам рутину, которая поможет детям более спокойно пережить это сложное время.

Обновленный режим работы медучреждений больничной кассы «Меухедет»
В связи с ситуацией в сфере безопасности и в соответствии с указаниями Министерства здравоохранения, в воскресенье...
В Израиле впервые пересадили искусственное сердце
В Израиле проведена успешная операция по трансплантации искусственного сердца.
Мобильная клиника: комплексное обследование для женщин рядом с домом
Около 140 женщин прошли обследование в передвижной клинике женского здоровья «Меухедет» в Гиватайме...
Прощайте, длинные очереди: новые услуги, которые обеспечат вам качественную и быструю медицинскую помощь
Сегодня в Израиле остро ощущается нехватка врачей-специалистов. Эта ситуация знакома...
Коалиция не поддержала новоназначенного руководителя ШАБАК
"Замена человека с мировоззрением с Каплан другим человеком с похожим мировоззрением не решает проблему, а лишь увековечивает...
Израиль продал вооружений на рекордные 14,8 млрд долл
Экспорт оборонной продукции Израиля в 2024 году составил рекордные $14,8 млрд.
«Битуах Леуми» меняет схему оплаты за резервистскую службу: вы получите больше
"Битуах Леуми" изменяет систему оплаты компенсации за резервистскую...
5 ловушек в автостраховке, о которых не предупреждает реклама, — и как не попасть на тысячи шекелей, «экономя» пару сотен
Все базовые полисы автострахования...
Пошлины Трампа: последствия для Израиля
Надежда правительства Израиля на то, что отмена последних остававшихся пошлин на американскую сельхозпродукцию позволит избежать введения американских...
Израиль отменил все пошлины на импорт из США
Израиль отменил все таможенные пошлины на товары, импортируемые из США
Деятели кино призвали к бойкоту Израиля
Более 4000 деятелей кино подписали письмо с призывом бойкотировать израильскую индустрию.
Шуфутинский назвал 3 сентября народным праздником
Михаил Шуфутинский, автор песни «Третье сентября», в беседе с ТАСС выразил мнение, что этот день стал народным праздником, объединяющим людей.
Пропалестинцы «выдавили» Гадот с Венецианского кинофестиваля
Израильская актриса Галь Гадот не приедет на 82-й Венецианский...
Фильм «Малахи» — лауреат первой премии Иерусалимского кинофестиваля
Документальный фильм «Малахи», снятый режиссерами Идо Багатом и Ноамом...
Нынче у нас время слихот, поэтому для начала позвольте повиниться, рассказать о моей давней ошибке. 12 лет тому назад, после окончания очередной не слишком большой войнушки, завершившейся очередным перемирием - как выяснилось потом, не слишком долгим, я написал заметку, которая называлась “В Газе нет рейхстага”. Главой правительства, кстати, был тогда все тот же Нетаниягу, а Газой владел все тот же Хамас - оба, если смотреть из сегодняшних дней, одинаково безальтернативные.

В своём «праве»
В последнее время появилось много групп, ставящих своей целью дестабилизацию и, в перспективе, террор. Что...
Выживание против Красной смерти
Ужасная пандемия фашиствующей левизны представляет собой поистине...
Не время подставлять другую щёку
Вчера я слушал трансляцию церемонии, посвященной...
Банальные лицемеры
Ко всем левым, которые сегодня отчаянно пытаются откреститься от...
Настало время диктовать свои условия истории
"Рош-ха-Шана – это Суд. Суд над народами и над...
Репатриация в условиях войны: психологическая поддержка новых репатриантов
Сегодня тысячи новых репатриантов в Израиле оказались в ситуации,...
Организация «Маса» удостоена «Иерусалимской премии за вклад в единство еврейского народа»
В резиденции президента Израиля в Иерусалиме...
Празднуем Песах на иврите: что нужно знать новым репатриантам
Вы, конечно, знаете, что такое маца. А Агада? А херут? Если вы новый репатриант, вам пригодятся базовые слова и фразы на иврите, связанные с...
Как сегодня работают частные ульпаны в Израиле?
В конце 2024 года многие новые репатрианты столкнулись с проблемой: Министерство алии и интеграции временно остановило программу «Ваучер» по изучению...
Образование для детей, волонтерство для родителей: новый проект «Масы» и НААЛЕ
Организация "Маса", основанная ЕА "Сохнут" и правительством Израиля, уже 21 год содействует участию молодежи из разных стран в...
Олимпийский пиар, или «Как победить Олимпиаду»
После утверждения России, что у них украли золотую медаль по художественной гимнастике, Ядида написал сатирический...
Наши резервы
Мне совершенно не мешает ходить "оборванцем". И вот я вышел из дома в своем обычном виде по делам на угол Бегин-Каплан. В разгар...
Проверка Бузагло
"-Как дела, милые? — спросил входящий в зал человек. -Репетируем удивлённое выражение лица! — ответили многоуважаемые."