Израильские ученые создали базу генетических данных помидоров
03.05.2021 13:29Беспрецедентная по своим масштабам база данных поможет исследователям и селекционерам разгадать тайны любимого во всем мире овоща.
Дикие помидоры, произрастающие в Южной Америке, древние родственники современных сортов, несут в себе гены многих желательных свойств - вкуса, аромата, устойчивости к болезням, - которые в некоторых случаях были утрачены в процессе одомашнивания и селекции.
В настоящее время селекционеры изучают возможность повторного внедрения этих утраченных "диких" черт в генотип окультуренных томатов. Им поможет в этой работе огромная база данных, охватывающая генетические и метаболические признаки как диких, так и культурных помидоров, созданной под руководством профессора Асафа Аарони из Научного института им. Вейцмана в сотрудничестве с учеными из Еврейского университета в Иерусалиме и других академических стуктур.
Исследователи использовали почти 600 линий гибридов томатов, названных BIL («обратное скрещивание инбредных линий»), созданных группой профессора Дани Замира из Еврейского университета, для составления базы данных, которую они назвали (разумеется) KILBIL. Каждая линия - помесь диких перуанских томатов Solanum pennellii и обычного культурного сорта Solanum lycopersicum - содержит разные части дикого и культивируемого генома, поэтому, сравнивая геномы разных гибридов и соотнося эти различия с разными качествами помидоров, можно установить, какие именно гены отвечают за конкретные "черты характера". Таким образом, ученые создали исчерпывающий профиль каждой линии, который включает около 11000 генов, списки до 1000 активных ингредиентов, называемых метаболитами, на разных стадиях созревания, а также информацию о чувствительности к грибковым патогенам. Затем исследователи применили вычислительные инструменты, чтобы сопоставить различные части генома томата или даже отдельные гены с вариациями метаболизма растений и другими особенностями.
База данных KILBIL поможет исследователям и селекционерам производить улучшенные сорта томатов. Сами же исследователи Института Вейцмана уже применяют свою базу данных, чтобы разгадать несколько старых загадок так знакомого всем нам овоща. Например, все мы знаем, что зеленые помидоры горькие - в основном потому, что они содержат значительное количество альфа-томатина, токсичного вещества, которое защищает помидоры от бактерий, грибков и травоядных животных до того, как они созреют. По мере созревания томатов альфа-томатин превращается в метаболиты, лишенные горечи, и до сих пор было неясно, как этот процесс координируется со созреванием плода, а также почему токсичный альфа-томатин не вредит самому растению.
Доктор Яна Казачкова, научный сотрудник лаборатории проф. Аарони, ответила на эти вопросы с помощью необычного вида диких томатов, плоды которого остаются горькими даже после созревания. (Помидоры ботанически классифицируются как фрукты, хотя диетологи обычно включают их в число овощей.) Исследователи, обнаружившие эти помидоры в Андах в 1990-х годах, предположили, что они остаются горькими из-за одной или нескольких мутаций в ферментах биосинтеза альфа-томатина.
Казачкова вместе с коллегами сравнила генетический состав горьких помидоров с обычными и свела разницу к одной мутации в гене, который кодирует совсем не фермент, преобразующий горький вкус в сладкий, а белок-переносчик, который переносит вещества внутри клетки. Исследователи назвали его GORKY - «горький». Затем Казачковой нужно было доказать, что мутировавший ген GORKY действительно отвечает за горький вкус этого своеобразного дикого вида томатов. В серии экспериментов она использовала технологию CRISPR, чтобы подавить этот ген в некоторых растениях и вызвать его чрезмерную экспрессию в других, и проанализировала метаболизм мутантных растений с помощью специального масс-спектрометрического оборудования в лаборатории проф. Аарони.
Доктор Казачкова была рада, когда помидоры, у которых был подавлен ген GORKY, действительно оказались... горькими. По ее словам, «это были самые вкусные горькие помидоры, которые я пробовала в своей жизни.»
Оказалось, что когда зеленые помидоры производят альфа-томатин в больших количествах, в основном в кожуре, они удерживают это токсичное вещество в закрытых отсеках, известных как вакуоли, что не позволяет яду повредить само растение. Когда томат созревает, белок GORKY уносит альфа-томатин за пределы вакуолей, позволяя ему путем пяти биохимических реакций превращаться в нетоксичные метаболиты, тем самым делая томат приятным на вкус.
Результаты исследования могут быть использованы для улучшения селекции томатов, и они также открывают подобные направления исследований и других растений в поисках подобных механизмов белков-переносчиков.
Авторы исследования: доктор Саянтан Панда, доктор Шмуэль Буковза, доктор Андрей Вайнер, доктор Илана Рогачев, доктор Юнхуэй Донг, доктор Шифра Бен-Дор и доктор Саймон Михаэли с отделения наук о растениях и окружающей среде Института Вейцмана; Д-р Итай Цемах и профессор Дани Замир из Еврейского университета в Иерусалиме; д-р Доротия Верес, д-р Криста Канструп, д-р Софи Констанц Ламбертц, д-р Кристоф Кроколл и д-р Хусам Хассан Нур-Элдин из Копенгагенского университета; и доктор Янцзе Ху и профессор Элон Шани из Тель-Авивского университета.
Источник: MFA
Фотоиллюстрация: Pixabay
Читайте также:

Израильские ученые пометили супербактерии, чтобы их смогла распознать и уничтожить иммунная система
Новый метод универсален для привлечения...
Израильские ученые: известное лекарство от холестерина помогает и от COVID-19
Исследование, возглавляемое Еврейским университетом в Иерусалиме,...
Исследователи Еврейского университета в Иерусалиме разрабатывают новые методы борьбы с ожирением
Группа исследователей Института исследований лекарственных...
Теория Дарвина в действии: морская актиния и ученые Еврейского университета
Исследования показали, что морские анемоны меняют состав своего яда несколько раз в жизни в соответствии...
Израильские ученые использовали ГМО для поиска мин
Израильские биологи из Еврейского университета в Иерусалиме нашли новое применение для ГМО.Лента новостей:


ЦАХАЛ нанес ночной авиаудар по инфраструктуре «Хизбаллы» в долине Бекаа
В ночь на пятницу, 30 мая, израильские ВВС атаковали террористическую...
Белый дом: Израиль согласился на сделку, от ХАМАСа ответ еще не получен
В сообщении говорится, что Израиль согласился с предложением, от ХАМАСа пока ответ не получен.
Израиль подвергся ракетному обстрелу с территории Йемена, перехвачена одна ракета
Около 21:18, Армия обороны Израиля сообщила о запуске ракеты с территории Йемена...
«Cуверенитет в Иудее и Самарии»: председатель Союза баптистов д-р Даг Томпсон с официальным визитом в Шомроне
Д-р Даг Томпсон, один из ведущих христианских лидеров США и президент EZPAC -...
ЦАХАЛ: десятки целей ХАМАСа уничтожены в секторе Газа за прошедшие сутки
В течение последних суток Армия обороны Израиля нанесла удары по десяткам целей террористических...
Звезда Галь Гадот на Аллее славы подверглась вандализму
На голливудской Аллее славы были нанесены оскорбительные и антиизраильские надписи на звезду израильской актрисы...
Трамп: я сказал Нетаниягу, что нанесение удара по Ирану будет крайне неуместным
"Я сказал Нетаниягу, что сейчас это делать крайне неуместно, потому...
СМИ: Прокурор МУС готовил ордеры на арест Бен-Гвира и Смотрича
Прокурор МУС Карим Хан перед уходом в административный отпуск подготавливал материалы для ходатайств об аресте Бецалеля Смотрича и Итамара Бен-Гвира....
Урсула фон дер Ляйен назвала удары Израиля по Газе «отвратительными»
Глава ЕС Урсула фон дер Ляйен в разговоре с Абдаллой II назвала "отвратительной" волну ударов Израиля по объектам...
Драматический ультиматум Дональда Трампа Ирану после угроз Хаменеи
Американские источники сообщили, что Иран получил от США ультиматум с требованием принять решение относительно...
Израильский хайтек привлёк 4 млрд долл за год
Это более чем в два раза превышает показатель предыдущего года.
Израильский туризм: теперь на подъем или дальше в пропасть?
Во время войны самый сильный экономический удар пришелся именно по туристической отрасли и в первую очередь – по...
Шпионский стартап, в который вложился Эхуд Барак, продан почти за миллиард
Значительная часть сделки будет оплачена наличными.
Edwards Lifescience покупает израильский медицинский стартап за 300 млн долл
Стартап разработал более безопасную микроинвазивную технологию лечения заболеваний митрального...
Google обсуждает покупку израильского стартапа за 23 млрд долл
Google ведет переговоры о приобретении израильского стартапа в сфере кибербезопасности Wiz.
ЦАХАЛ успешно применил лазерную систему ПРО «Щит света» для перехвата БПЛА «Хизбаллы»
ЦАХАЛ успешно применил лазерную систему "Щит света" ("Маген Ор") для...
Во время войны были осуществлены испытания израильской лазерной ПРО
Речь идет о беспрецедентном достижении в разгар боевых действий.
Израильские ученые научили ИИ читать электрокардиограммы и разъяснять диагноз
Ученые Хайфского Техниона научили ИИ читать электрокардиограммы и разъяснять диагноз врачу.
Израильские ученые заставили раковые клетки выдавать себя иммунной системе
Ученые из Института Вейцмана предложили новый метод лечения, который многократно...
Израильские ученые ускорили чтение данных из ДНК-хранилища в тысячи раз
Учёные из хайфского Техниона создали основанный на ИИ метод, ускоряющий на три порядка чтение данных с ДНК-носителей...
ЦАХАЛ нанёс удар по штабу террористов, расположенному на территории бывшей школы
В ночь на воскресенье армия обороны Израиля и служба безопасности...
Мобильная клиника: комплексное обследование для женщин рядом с домом
Около 140 женщин прошли обследование в передвижной клинике женского...
Прощайте, длинные очереди: новые услуги, которые обеспечат вам качественную и быструю медицинскую помощь
Сегодня в Израиле остро ощущается нехватка врачей-специалистов. Эта ситуация знакома...
ЦАХАЛ разрушил дом террориста, совершившего наезд у перекрёстка Нир-Цви
ЦАХАЛ уничтожил дом террориста, совершившего теракт на перекрёстке Нир-Цви, в результате которого погиб капитан...
Коалиция не поддержала новоназначенного руководителя ШАБАК
"Замена человека с мировоззрением с Каплан другим человеком с похожим мировоззрением не решает проблему, а лишь увековечивает...
Пошлины Трампа: последствия для Израиля
Надежда правительства Израиля на то, что отмена последних остававшихся пошлин на американскую сельхозпродукцию позволит избежать введения...
Израиль отменил все пошлины на импорт из США
Израиль отменил все таможенные пошлины на товары, импортируемые из США
Израиль отменит все пошлины на импорт американских товаров уже сегодня
Цель - предотвратить введение пошлин против Израиля со стороны администрации Дональда Трампа.
ЦСБ: средняя зарплата в Израиле выросла до рекордного уровня
ЦСБ:в декабре 2024 года средняя зарплата в Израиле выросла на 10%, достигнув исторического рекорда.
В Центре наследия Алон Морэ откроется новая выставка, приуроченная к Дню освобождения Иерусалима и Шомрона. На ней впервые будут представлены редкие цветные фотографии, сделанные в 1968 году, всего через год после окончания Шестидневной войны.

Голосование зрителей на Евровидении заткнуло рот ненавистникам Израиля
Юваль Рафаэль поразила весь мир, заняв второе место на конкурсе Евровидение, который прошел в Базеле....
Празднуем День независимости в сердце страны: фестиваль в парке Нахаль Кане, Самария
В предстоящий День независимости (1 мая) Региональный совет...
Спилберг возглавил список богатейших селебрити от Forbes
Режиссер Стивен Спилберг возглавил список богатейших знаменитостей...
На Аллее славы Голливуда появилась звезда Галь Гадот
Израильская актриса Галь Гадот стала обладательницей именной звезды на...
Галь Гадот наградили за поддержку Израиля
«Галь Гадот – героиня как на экране, так и за его пределами, она – неустанная...
Левый мир — за открытые границы и миграцию, считая переселение народов древним и обычным явлением, при этом хитро забывая о главном: мигранты из Европы в Америку, Австралию, Африку и Азию несли прогресс, поднимали экономику, занимались цивилизацией дикарей.

Момент истины для нас как для общества
"Каждый голос, отданный за Яира Голана на выборах — это голос израильтянина,...
Перед нами — политический лагерь, полностью сошедший с рельсов
"Год и семь месяцев спустя после резни...
Кто сдал Синуара — и почему?
Не удивлюсь, если однажды выяснится, что местонахождение...
Вся правда о генетическом тесте ДНК в Израиле
Бюрократическая система нашей страны...
Договор Трампа с хуситами — капитуляция или манёвр?
После вчерашнего заявления Трампа о возможном соглашении с хуситами...
В резиденции президента Израиля в Иерусалиме состоялась сегодня, 29 мая, торжественная церемония вручения Иерусалимской премии за единство Израиля, в ходе которой были отмечены организации и личности, вносящие значительный вклад в укрепление связей между различными слоями израильского общества и между Израилем и еврейской диаспорой. Среди лауреатов премии — организация «Маса», признанная в международной категории за уникальный вклад в единство еврейского народа в Израиле и по всему миру.

Празднуем Песах на иврите: что нужно знать новым репатриантам
Вы, конечно, знаете, что такое маца. А Агада? А херут? Если вы новый репатриант, вам пригодятся базовые...
Как сегодня работают частные ульпаны в Израиле?
В конце 2024 года многие новые репатрианты столкнулись с проблемой: Министерство алии и интеграции временно...
Образование для детей, волонтерство для родителей: новый проект «Масы» и НААЛЕ
Организация "Маса", основанная ЕА "Сохнут" и правительством Израиля, уже 21 год содействует участию молодежи из разных стран в...
Новым гендиректором организации «Маса» стал Меир Хольц
Генеральным директором программы «Маса» назначен г-н Меир Хольц. Хольц, до недавнего времени, занимал должность гендиректора организации...
Как сегодня учат иврит в ульпанах
Один из ключевых факторов интеграции в Израиле – это, конечно же, знание иврита. Чем быстрее вы выучите язык, тем легче и быстрее освоитесь в Израиле. Но как же учить иврит быстро...
Олимпийский пиар, или «Как победить Олимпиаду»
После утверждения России, что у них украли золотую медаль по художественной гимнастике, Ядида написал сатирический...
Наши резервы
Мне совершенно не мешает ходить "оборванцем". И вот я вышел из дома в своем обычном виде по делам на угол Бегин-Каплан. В разгар...
Проверка Бузагло
"-Как дела, милые? — спросил входящий в зал человек. -Репетируем удивлённое выражение лица! — ответили многоуважаемые."