Израильские ученые создали базу генетических данных помидоров

03.05.2021 13:29

Беспрецедентная по своим масштабам база данных поможет исследователям и селекционерам разгадать тайны любимого во всем мире овоща.

Дикие помидоры, произрастающие в Южной Америке, древние родственники современных сортов, несут в себе гены многих желательных свойств - вкуса, аромата, устойчивости к болезням, - которые в некоторых случаях были утрачены в процессе одомашнивания и селекции. 

В настоящее время селекционеры изучают возможность повторного внедрения этих утраченных "диких" черт в генотип окультуренных томатов. Им поможет в этой работе огромная база данных, охватывающая генетические и метаболические признаки как диких, так и культурных помидоров, созданной под руководством профессора Асафа Аарони из Научного института им. Вейцмана в сотрудничестве с учеными из Еврейского университета в Иерусалиме и других академических стуктур.

Исследователи использовали почти 600 линий гибридов томатов, названных BIL («обратное скрещивание инбредных линий»), созданных группой профессора Дани Замира из Еврейского университета, для составления базы данных, которую они назвали (разумеется) KILBIL. Каждая линия - помесь диких перуанских томатов Solanum pennellii и обычного культурного сорта Solanum lycopersicum - содержит разные части дикого и культивируемого генома, поэтому, сравнивая геномы разных гибридов и соотнося эти различия с разными качествами помидоров, можно установить, какие именно гены отвечают за конкретные "черты характера". Таким образом, ученые создали исчерпывающий профиль каждой линии, который включает около 11000 генов, списки до 1000 активных ингредиентов, называемых метаболитами, на разных стадиях созревания, а также информацию о чувствительности к грибковым патогенам. Затем исследователи применили вычислительные инструменты, чтобы сопоставить различные части генома томата или даже отдельные гены с вариациями метаболизма растений и другими особенностями.

База данных KILBIL поможет исследователям и селекционерам производить улучшенные сорта томатов. Сами же исследователи Института Вейцмана уже применяют свою базу данных, чтобы разгадать несколько старых загадок так знакомого всем нам овоща. Например, все мы знаем, что зеленые помидоры горькие - в основном потому, что они содержат значительное количество альфа-томатина, токсичного вещества, которое защищает помидоры от бактерий, грибков и травоядных животных до того, как они созреют. По мере созревания томатов альфа-томатин превращается в метаболиты, лишенные горечи, и до сих пор было неясно, как этот процесс координируется со созреванием плода​, а также почему токсичный альфа-томатин не вредит самому растению.

Доктор Яна Казачкова, научный сотрудник лаборатории проф. Аарони, ответила на эти вопросы с помощью необычного вида диких томатов, плоды которого остаются горькими даже после созревания. (Помидоры ботанически классифицируются как фрукты, хотя диетологи обычно включают их в число овощей.) Исследователи, обнаружившие эти помидоры в Андах в 1990-х годах, предположили, что они остаются горькими из-за одной или нескольких мутаций в ферментах биосинтеза альфа-томатина.

Казачкова вместе с коллегами сравнила генетический состав горьких помидоров с обычными и свела разницу к одной мутации в гене, который кодирует совсем не фермент, преобразующий горький вкус в сладкий, а белок-переносчик, который переносит вещества внутри клетки. Исследователи назвали его GORKY - «горький». Затем Казачковой нужно было доказать, что мутировавший ген GORKY действительно отвечает за горький вкус этого своеобразного дикого вида томатов. В серии экспериментов она использовала технологию CRISPR, чтобы подавить этот ген в некоторых растениях и вызвать его чрезмерную экспрессию в других, и проанализировала метаболизм мутантных растений с помощью специального масс-спектрометрического оборудования в лаборатории проф. Аарони.

Доктор Казачкова была рада, когда помидоры, у которых был подавлен ген GORKY, действительно оказались... горькими. По ее словам, «это были самые вкусные горькие помидоры, которые я пробовала в своей жизни.»

Оказалось, что когда зеленые помидоры производят альфа-томатин в больших количествах, в основном в кожуре, они удерживают это токсичное вещество в закрытых отсеках, известных как вакуоли, что не позволяет яду повредить само растение. Когда томат созревает, белок GORKY уносит альфа-томатин за пределы вакуолей, позволяя ему путем пяти биохимических реакций превращаться в нетоксичные метаболиты, тем самым делая томат приятным на вкус.

Результаты исследования могут быть использованы для улучшения селекции томатов, и они также открывают подобные направления​ исследований и других растений в поисках подобных механизмов белков-переносчиков.

Авторы исследования: доктор Саянтан Панда, доктор Шмуэль Буковза, доктор Андрей Вайнер, доктор Илана Рогачев, доктор Юнхуэй Донг, доктор Шифра Бен-Дор и доктор Саймон Михаэли с отделения наук о растениях и окружающей среде Института Вейцмана; Д-р Итай Цемах и профессор Дани Замир из Еврейского университета в Иерусалиме; д-р Доротия Верес, д-р Криста Канструп, д-р Софи Констанц Ламбертц, д-р Кристоф Кроколл и д-р Хусам Хассан Нур-Элдин из Копенгагенского университета; и доктор Янцзе Ху и профессор Элон Шани из Тель-Авивского университета.

 

Источник: MFA
Фотоиллюстрация: Pixabay 

Отправьте эту страницу друзьям!

Оставьте свой комментарий!

Читайте также:

Наука и технологии
25.03.2018

Теория Дарвина в действии: морская актиния и ученые Еврейского университета

Исследования показали, что морские анемоны меняют состав своего яда несколько раз в жизни в соответствии...
Наука и технологии
14.04.2017

Израильские ученые использовали ГМО для поиска мин

Израильские биологи из Еврейского университета в Иерусалиме нашли новое применение для ГМО.

Лента новостей:

Израиль
Израиль
17.01.2025

Опубликован список 33 заложников, которых освободят на первом этапе сделки

Опубликован список из 33 заложников, которые должны быть освобождены в рамках первого этапа соглашения...
Израиль
16.01.2025

«Ционут Датит» требует расторгнуть договор с ХАМАСом после первого этапа

Бецалель Смотрич потребовал от Биньямина Нетаниягу обещать ему, что война будет продолжена до окончательной победы....
В мире
В мире
15.01.2025

Эрдоган требует, чтобы Израиль ушел из Сирии и грозит последствиями

"Агрессивные действия сил, атакующих сирийскую территорию, в частности Израиля, должны быть прекращены как...
В мире
15.01.2025

Илон Маск купит TikTok?

В США пошли разговоры о возможности продажи американского подразделения TikTok Маску.
В мире
15.01.2025

Байден ограничил поставки графических процессоров в Израиль

Уходящий президент США Джо Байден нанес серьезный удар по Израилю
Бизнес
Бизнес
24.12.2024

Израильский туризм: теперь на подъем или дальше в пропасть?

Во время войны самый сильный экономический удар пришелся именно по туристической отрасли и в первую очередь – по...
Бизнес
17.07.2024

Edwards Lifescience покупает израильский медицинский стартап за 300 млн долл

Стартап разработал более безопасную микроинвазивную технологию лечения заболеваний митрального...
Бизнес
15.07.2024

Google обсуждает покупку израильского стартапа за 23 млрд долл

Google ведет переговоры о приобретении израильского стартапа в сфере кибербезопасности Wiz.
Бизнес
9.07.2024

IAI сообщила о сделке с иностранным клиентом на 1 млрд долл

Данная сделка - одна из крупнейших в истории концерна, хотя и не самая крупная.
Наука и технологии
Наука и технологии
7.01.2025

Марк Цукерберг: Facebook прекращает факт-чекинг и ослабляет цензуру

Глава компании Meta Марк Цукерберг объявил, что социальная сеть Facebook больше не будет заниматься проверкой...
Наука и технологии
24.12.2024

Муравьи решают сложную задачу по транспортировке лучше, чем люди. Израильское исследование

Израильские ученые сравнили способности людей и муравьев к координации действий при решении...
Наука и технологии
18.12.2024

В дома израильтян запустили энергию от волн

Это первый в мире случай, когда энергия волн используется в масштабах государства.
Наука и технологии
18.12.2024

Израиль запустил первый квантовый компьютер

Компьютер был разработан специалистами израильской компании IAI.
Медицина
Медицина
19.11.2024

В бою на юге Ливана погиб военнослужащий ЦАХАЛа

На юге Ливана погиб старший сержант резерва Омер Моше Гаэльдор.
Медицина
12.11.2024

В бою на севере сектора Газы погибли четверо израильских солдат

В бою на севере сектора Газы погибли четверо израильских военнослужащих.
Медицина
28.10.2024

В больнице умер майор Гай Яаков Незри, получивший ранения в Газе

В больнице от ран, полученных 19 октября в бою на севере сектора Газы, умер майор Гай Яаков Незри.
Медицина
14.08.2024

Помощь инвалидам ЦАХАЛа с черепно-мозговыми травмами

В этом центре раненые солдаты находят не только профессиональную поддержку и интересные занятия, но и дружеское общение
Медицина
15.07.2024

В Израиле удвоилось число жертв вируса Западного Нила

Вирус Западного Нила диагностировали уже у 440 израильтян. Зафиксировано 32 летальных исхода.
Деньги
Деньги
17.12.2024

Налоговое управление подтвердило повышение налогов на автомобили в 2025 году

С 2025 года в Израиле увеличатся налоги на покупку всех типов автомобилей....
Деньги
17.12.2024

Кнессет принял решения об увеличении налоговой нагрузки на граждан

Некоторые депутаты выразили недовольство тем, что меры негативно скажутся...
Деньги
21.08.2024

JPMorgan снизил прогноз израильской экономики

Американский инвестиционный банк JPMorgan опубликовал пересмотренный прогноз для израильской экономики.
Деньги
13.08.2024

Агентство Fitch понизило кредитный рейтинг Израиля

Fitch Ratings объявило этой ночью о понижении кредитного рейтинга Израиля.
Культура
Культура
1.01.2025

Актёр Стивен Фрай стал рыцарем

По словам Фрая, он был «совершенно ошарашен», узнав о своем новом статусе.
Культура
16.10.2024

Израиль и еврейская диаспора отмечают праздник Суккот

Неделя пребывания в шалашах посвящена памяти об исходе из Египта.
Культура
23.09.2024

Мы снова будем танцевать

Документировать и творчески переосмысливать события 7 октября 2023 года израильские деятели искусств начали...
Культура
9.09.2024

Делай добро и дари его близким

В центре реабилитации для солдат ЦАХАЛа пройдёт ярмарка изделий ручной работы в преддверии Рош а-Шана...
Культура
8.07.2024

Умер продюсер «Титаника» и «Аватара» Джон Ландау

В возрасте 63 лет скончался продюсер Джон Ландау, лауреат премии «Оскар» за фильм «Титаник»,...
Публицистика
Публицистика
16.01.2025
 Лев Клоц

Дальше — будет дальше

"Мы завоевали, мы проиграли, мы отдали, мы договорились ." Лично я не принимал участия в заседаниях узкого кабинета....
Публицистика
16.01.2025
 Виктор Шендерович

Коротко о сделке, самым общим планом

"Израиль - унижен. А побежден, по итогам последствий резни...
Публицистика
16.01.2025
 Юрий Моор

Можно ли победить Газу

Нетаниягу заплатил слишком дорого за освобождение заложников? Эта цена...
Публицистика
14.01.2025
 Евгений Либерман

Если не мы нам, то кто нам?

На мой взгляд, Трамп в первой каденции оценивал политическую важность Израиля...
Публицистика
14.01.2025
 Сурен Карапетов

Герои, которых мы выбираем

Этому человеку довелось жить в стране, которая по международным...
Репатриация
Репатриация
4.09.2024

Новым гендиректором организации «Маса» стал Меир Хольц

Генеральным директором программы «Маса» назначен г-н Меир Хольц. Хольц, до недавнего времени, занимал...
Репатриация
28.08.2024

Как сегодня учат иврит в ульпанах

Один из ключевых факторов интеграции в Израиле – это, конечно же, знание иврита. Чем быстрее вы выучите язык, тем легче и быстрее...
Репатриация
27.08.2024

Война не остановила репатриантов

После нападения террористов ХАМАСа на Израиль в октябре прошлого года в еврейское государство прибыло 29 тыс. репатриантов.
Репатриация
25.06.2024

«Маса-Учителя» подводит итоги самого сложного учебного года за всю историю программы

Во вторник, 25 июня, состоялась церемония завершения программы "Маса-Учителя", в рамках которой...
Репатриация
19.05.2024

Сотни мероприятий, десятки проектов, 180 пар: «Мидраше Ционит» исполняется 25 лет

«Мидраша Ционит» - еврейская международная организация была основана Шломо Нееманом, бывшим главой Совета...
Юмор
Юмор
9.08.2021

Олимпийский пиар, или «Как победить Олимпиаду»‎

После утверждения России, что у них украли золотую медаль по художественной гимнастике, Ядида написал сатирический...
Юмор
30.01.2021
 Борис Прусский

Лимерика

Израильский певец и музыкант Борис Прусский посвятил шуточное стихотворение инаугурации...
Юмор
16.07.2020

Наши резервы

Мне совершенно не мешает ходить "оборванцем". И вот я вышел из дома в своем обычном виде по делам на угол Бегин-Каплан. В разгар...
Юмор
27.05.2020

Проверка Бузагло

"-Как дела, милые? — спросил входящий в зал человек. -Репетируем удивлённое выражение лица! — ответили многоуважаемые."
Юмор
16.05.2020

Ограбление

Охана, владелец фирмы "Мойдодыр", совсем было собирался закрыть свой магазин, когда в помещение внезапно ворвался подозрительный тип с закрытым...